红豆杉扦插应于5～6月份春夏之交进行。插穗从4年生以上树龄的母株上选取，剪成15厘米的插条。2年生幼枝作插穗成活率高。为促进早生根，可将插穗基部浸入0.01%的萘乙酸或0.01%吲哚乙酸溶液中3小时，然后取出插入育苗床上。
苗床基质用蛭石加风化砂(1∶1)或河砂、腐植质土。扦插前剪去插穗下部的小枝和针叶，插深3～5厘米，株行距8～10厘米。插后浇透水，苗床用薄膜拱罩保湿，每日喷水2次，2周后每日喷水1次，每次每平方米喷水量1～1.5公斤。
扦插后苗床周围修好排水沟，约16天左右，气温逐渐升高，日照强烈，再在薄膜棚上搭遮阴棚，透光率为40%～50%。当棚内温度上升到30℃时，将棚两端薄膜揭开通风，使温度降低。苗床内发现杂草应及时拔除，切勿触动插穗。10月初松土1次。
红豆杉插穗在7月上旬以前为愈伤组织形成时期，7月下旬植株明显分化，已生根的叶色正常，开始抽出新梢。未生根者叶色变黄逐渐枯死。8月上旬至9月下旬地下根系发育迅速，10月上旬苗木大部分封顶。2～3年可定植在阴山坡或平地。定植后的第一年要遮阴，5年生以上红豆杉可以药用。