茎腐病是大叶黄杨极易感染的一种主要病害，严重时可造成全株枯死。受冬春季节特殊气候的影响，大叶黄杨返青不理想，会出现一些枯死枝，致使黄杨生长势减弱，从而降低了植株的抗病力。有些大叶黄杨容易发生茎腐病。尤其是一二年生枝条受害最严重，初期茎部变为褐色，叶片失绿，嫩梢下垂，叶片不脱落，后期茎部受害部位变黑，皮层皱缩，内皮组织腐烂，生有许多细小的黑色小菌核，同时受害部位迅速发展，病菌侵入木质部，导致全株枯死。
大叶黄杨茎腐病发病原因：半知菌纲的病菌，该病菌平时在土壤中营腐生生活。夏季气温上升，土壤温度也随之升高，病菌侵入苗木茎部为害。尤其在高温、低洼地区，发病较为普遍。
针对大叶黄杨茎腐病的发病原因，我们常采取以下措施进行防治：
1、加强苗木的养护管理，提高其自身的抗病能力。
2、使用充分腐熟的农家肥作为基肥，可降低苗木发病率。
3、夏季幼苗采取搭阴棚等降温措施，大苗可采用栽植地被植物或地面覆草等方法，来破坏病菌发生的环境条件。
4、及时剪除发病枝条，集中烧毁。
5、发病苗木量小时，可用毛刷涂50倍50％的多菌灵溶液或50倍25％的敌力脱乳油（丙唑灵）于发病初期的茎秆处。苗木量大或发病盛期时，在苗木上普遍喷施必菌鲨800至1000倍液、喷克菌2000-2500倍液。两种方法均是7天一次，连续进行2至3次，能起到预防和治疗的作用。