常见的小苍兰病害有：小苍兰菌核病、小苍兰花叶病和小苍兰坏死斑病。
①小苍兰菌核病。病原菌从叶鞘处侵入，叶鞘呈淡褐色或淡黄褐色，然后入侵茎基部和球根，使之发生腐烂，导致植株生长不良，逐渐枯萎。防治方法：用无病的球根繁殖，多施有机肥少施氮肥和适当控制浇水量不让土壤过湿，可防止菌核病发生；病害发生后及时拔除病株集中销毁，并用70%甲基托布津1000倍液或50%的多菌灵1000倍液喷洒。
②小苍兰花叶病。在小苍兰叶片上出现褐色条斑，花瓣上出现退绿斑纹，严重时叶片扭曲。防治方法：用40%氧化乐果1500倍液或2.5%氯氰菊酯3000倍液及时喷洒，消灭蚜虫等传播者，发现病株应及时拔除销毁。
③小苍兰坏死病斑。小苍兰叶片上出现坏死斑或环斑或花叶、坏死斑。防治方法：播种前消毒种球；生长期用40%氧化乐果1500倍液毒杀蚜虫、或用呋喃丹等毒杀线虫；发现病株，及时拔除销毁。
危害小苍兰的虫害主要是油葫芦。油葫芦的成虫和幼虫都能危害小苍兰的根、茎、叶。成虫喜欢躲藏在阴凉、潮湿疏松的土壤中或薄层积草内，夜间出来觅食，遇惊动逃避，产卵于田埂杂草中和草堆边缘的土中。
防治方法：①冬季结合翻土来灭杀越冬卵。②在草堆里放入毒饵来诱杀成虫，毒饵一般用麦黻、米糠和高粱黻5千克，炒成焦黄后拌入90%的敌百虫1000倍液1000~2000毫升，或50%辛硫磷1000倍液1000~2000毫升，再拌入鲜草放在油葫芦经常出没和躲藏的地方来诱杀。