微生物快速分析仪利用atp试剂中若干组分如荧光素-荧光素酶等与被测样本反应产生光子，再利用专门研制的荧光检测仪来捕捉和检测发光值，由于被测样本所含细菌等微生物的数量与所含的atp值、以及atp值与发光值之间存在一定的函数关系，因此通过检测发光值即能得到被测标本所含细菌等微生物含量。仪器为了满足现场快速检测的需求，微生物快速分析仪宜选择手持式从而实现流动状态即时检测。
当仪器和试剂配合使用，整体灵敏度达到10‐15‐10‐18摩尔atp范围时，可以用于食品表明微生物检测、手卫生检测、餐饮器具洁净度检测、重点科室和重要活动场所物表检测和卫生安保、食品加工器具、工作台等关键控制点消毒结果检测、医疗环境工作平台（器械表面、内窥镜、空调进出气口）卫生学即时评估，其实时监测数据能有效配合haccp或gmp体系管理的要求。
微生物快速分析仪检测步骤：
1、打开机器，点击检测，仪器提示“放入试子”进入检测界面
2、从冰箱中取出拭子，放置 10-15分钟，待恢复至室温后使用；
3、从套管里取出拭子，一手捏住连接头，擦拭物体表面， 45°倾斜，10×10 cm表面；
4、将采集器插回套管；一手捏住连接头，一手捏住囊体上部，来回弯折，直至折断阀门；
5、挤压拭子头3次，使拭子头中的液体全部被挤出；捏住拭子头，向下轻甩5下拭子，《立即》将拭子插入仪器中检测。
6、点击检测，15s后出检测结果。
微生物快速分析仪使用注意事项：
试剂质保期12个月、适应现场快速检测需要的一体化液态稳定检测拭子。
冷冻储存可保存五年；0至-4℃冷藏可保存10个月。