在清洗氟塑料化工泵的时候，先确保零件的清洁度符合要求。对于喷涂、电镀和粘结工件的表面，清洁要求很高。清洗时，须根据不同的要求采用不同的清洗剂和清洗方法，以保证所需的清洗质量。
防止零件腐蚀，零件不允许有任何程度的腐蚀。泵部件清洗后需要停放一段时间时，应考虑清洗液的防锈能力或其他防锈措施。
1、清洗水封管，检查水封管是否畅通。
2、清洁衬套和轴承，清除润滑脂，然后清洁油环和油位计。应该用汽油清洗滚珠轴承。
3、所有不需临时组装的零部件，清洗后应用油保护。
4、刮去叶轮、密封圈、轴承等内外表面积存的水垢和铁锈，然后用水或压缩空气吹净。
5、清除水泵壳体结合面上积聚的油脂和铁锈。
6、启动前须注满水。如果泵的中间低于吸入面，则无需灌溉，只需排出泵内的空气即可。
7、动机的转向应与泵的转向一致：在接通电源前，应拆下联接板(后轮)的连接螺钉，接通电源后检查电动机的旋转方向，然后重新连接，以防反转;
要注意的是，氟塑料化工泵在闸门关闭时启动，运行时间一般不超过2-3分钟。如果时间过长，泵内液体会发热，可能会造成事故，应及时停机。