唐菖蒲有性繁殖主要用于培育新的品种，具体操作如下：
①有性杂交。首先根据预定的目标，选择具有优良性状父本和母本。在授粉前一天将未开花的母本花穗，剪去上部仅保留下部的3~5朵花，然后用镊子去除花朵中的雄蕊，套上纸袋，防止其他花粉侵入。花粉取自未开放、成熟的父本花朵，之后涂在母本有黏液的柱头上，重新套袋扎好。人工杂交宜在春秋季进行为好，若在炎热夏季进行，将会造成不育或结实不良。
②采收杂交种子。授粉后约一个月，蒴果渐变黄、先端刚开裂时可逐个采收。
③播种。种子播种前先除去种翅，之后放在30~40℃温水中浸泡5~6小时，这样能使种子发芽整齐。采用撒播的方法，将种子播种在肥沃、疏松的培养土中，覆土0.5厘米，保持土壤湿润即可发芽。播种苗经培养当年就可获得直径为1厘米以上的小球茎。
④选种。新的小球茎需经一年以上的培育，才能长成开花球，而第1次开的花往往尚未稳定，故需待第2次开花后，进行选种较好。