在栽培矮牵牛过程中，无论是播种阶段还是生长阶段，基质的ph值都是至关重要的因素。如果矮牵牛叶片上出现花叶退绿现象时，很可能是由于基质的ph值高于6.8，从而导致植株缺铁引起的。在这种情况下可以浇灌硫酸亚铁来降低基质的ph值。用硫酸亚铁浇灌基质之后要用清水冲洗矮牵牛叶片。反之，如果矮牵牛叶片上出现黄褐色或棕褐色斑点时，则很可能是由于基质的ph值过低，从而导致植株出现铁或镁的毒害引起的。当基质的ph值低于5.5时，可用水溶性石灰水浇灌。
如果基质的ph值高且硼元素不足，矮牵牛将出现叶片扭曲、生长点枯死、分生组织以下侧枝大量增生现象。在矮牵牛的生长过程中，将基质的ph值控制在5.5~6.3是较适宜的，必要时要增施硼肥，生长阶段可施用1~2次硼肥。