蕨类植物的虫害主要有蚜虫、红蜘蛛、介壳虫、蛞蝓等。
蚜虫常见的有黑色和绿色两种，通常出现在早春和夏初，常群居于蕨类植物幼嫩茎梢处。为害时用刺吸式口器吮吸植物体内的汁液，使植物生长停滞，叶片变黄。另外，蚜虫的分泌物常招致各种霉菌的寄生，易产生煤污病。防治时，可先用肥皂水清洗，再喷施40％乐果或氧化乐果1000至1500倍液、杀灭菊酯2000至3000倍液、2.5％鱼藤精1000至1500倍液、敌百虫1000倍液杀灭。
红蜘蛛也是用刺吸式口器吮吸蕨类植物体内的汁液，使植物生长停滞，叶片发黄。由于其体形小，繁殖快，较难发现，若防治不及时，危害会很严重。高温持续季节采用三氯杀螨醇800至1000倍液、50％的氧化乐果1000倍液交替使用进行防治。
介壳虫寄生于蕨类植物叶片边缘或叶背面，其幼虫期很短，行动缓慢，当移动到叶背时，即开始结壳。用刺吸式口器吮吸植物体内的汁液，介壳虫繁殖速度快，危害严重时会抑制植物的生长并引起植株枯萎，严重时整株植株会枯黄死亡，同时诱发煤污病，一般没有特效药防治，以预防为主。在种植蕨类植物时，要控制叶面不要过湿，并经常检查叶片两面，一旦发现介壳虫可用毛刷将虫体刷掉或用镊子清除。在5月下旬介壳虫孵化时期，用40％的氧化乐果乳剂、50％的马拉硫磷、25％亚胺硫磷、80％敌敌畏乳剂1000倍液喷雾灭杀。介壳虫严重时，要将整片叶子剪掉焚烧。
蛞蝓，又称鼻涕虫。腹足纲，蛞蝓科。形状似去壳的蜗牛。壳通常退化，外套膜被覆全背部。触角两对，第二对顶端生眼。肺孔开于体前右侧，身体能分泌粘液，爬行后留下银白色条痕。初夏在树皮下及石下产白色的卵。它是危害蕨类植物的主要害虫之一，一般藏匿于盆钵的内壁，底部漏水孔处，或植株的基部及土壤表面的覆盖物下，常夜间出来活动，咬食蕨类植物的幼嫩叶片。可在夜间10点至11点钟喷施70至100倍的氨水杀灭，并同时达到施肥的目的。也可以通过人工捕捉杀灭。但蛞蝓再生能力强，捕到的蛞蝓要丢到盐酸溶液中杀死。