病害的发生大多由于高温，高湿，空气不洁和通风不良所致。低温多湿，或阳光不足的阴雨天，也是最容易发生，但无前者情形严重，在此情况下，兰花大多生长太快，组织柔弱，致使各种病菌容易自叶子的气孔中穿入体内。如果管理得当，兰株生长强健，各种病虫害就不易发生，但是病菌随风到处飞散，或早已有各种病菌存在兰花的叶面和茎上，只因环境条件不合，未能发生繁衍，倘若环境一旦适合，即迅速自气孔或伤处穿入组织内，及至发觉，已成病害，所以病虫与环境及管理有密切的关系。
为害兰花的病菌,大概有三种：
第一种是细菌(bacteria)，多在植物组织内繁殖，成熟后，即于叶面或患处分泌出如水滴状，因浇水，手触，昆虫及植株与植株的接触，而发生传染。
第二种是真菌(fungus)，是由像蜘蛛网体的菌丝，在兰花叶和茎内生长，生长的时候，迅速破坏植物组织，此类真菌唯一可看到的现象只有它的孢子，此种孢子，就像细菌一样可以传染各个植体。
第三种就是病毒(virus)，是一种生理与组织上的病害。
各种病菌，在春秋两季病菌的活动力较弱，所以在这两个季节可以每两至三星期施用一次杀菌粉1000倍稀释液来预防，而在夏季则是病菌活动力最强的时候，可以一至两个星期喷洒一次杀菌粉稀释液，而可湿性杀菌粉都会在植株上留下药斑，可加入展着剂合并使用，并保持叶片的净洁，所有的杀菌粉皆只能将在植株体外的病菌消灭，若是感染到真菌病时所有的患处应立即切除，已入侵于植株体内的病菌，是无法被杀菌粉所左右的，目前的杀菌粉是只能预防，并不能根治。
由于植物它不像动物，动物在受了伤，经过治疗伤口会慢慢的癒合，但是，植物一但有了病害后，经过治疗，叶子的叶肉组织再也不会长出来了，病症就会一直留在那边，直到那片有病症的叶子老化掉落。
一、真菌病害
侵害蝴蝶兰植株的真菌有1、phytophth a palmiv a;2、phytophth a parasiticao，这两种真菌在夏季高温多湿的季节最为猖獗，所有蝴蝶兰的植株也在此季受害最大，所以，前面一直强调栽培环境的重要，一般受真菌感染的病株，刚开始用肉眼可观察得到时，已是墨绿色向光透明的小斑污点，此污体快速很快，若发现蝴蝶兰有这种情况时，需要立即用刀剪去除患部，而去除的面积，需要较污渍点周边各宽10mm左右，以防有少部分真菌已侵入良好的组织内，但仍用肉眼无法辨别，所以去除部分必须连带周围的一些好的组织，其去除用的刀剪，刃部在使用前后，皆需用75%的酒精消毒，伤口亦用酒精擦拭涂抹，因酒精能烧灼伤口表面的细胞，亦能消灭任何附着于伤口的细菌，经涂抹酒精后的伤口，于第二、三天便可看到一层烧灼干瘪后的白色形成层，这表示受破坏的伤口已无碍了，不再受外来的细菌侵入和伤害。
经真菌感染后的株体，其患部用手轻触后表皮即破裂出水，并带有腥味，若真菌感染到叶心部位，这一棵蝴蝶兰需用立即将受感染的部位割除，以求保命，若没有发觉或不在意，那么这一棵蝴蝶兰可能回天乏术，对于普通品种来说，可能不必惋惜，若对于名种，那真的是得不偿失，虽然被割除生长部位的植株，其侧芽也不一定能完全成活，但只要切除后的伤口立即用75%酒精涂抹，一般长出侧芽的机会有七成以上，但在切除患部后，其给水量要减少到最低程度，并将患株置放于光线较弱的地方，以利其侧芽长出。患处经切除后，需妥善处理，以防真菌扩散，最好用火烧掉，或浸于消毒水中，当然，火烧是最经济又省事。
虽然经试验，根部无法直径受真菌感染，但却能由叶片或株茎感染至根部。在适当的环境下，整盆的聚合苗，只要有一棵小苗受到感染，而不将其处理，在两三天内整盆的小苗都会受到真菌侵袭，而全部死亡。所以建议用大聚合盆的兰友，需要注意这个缺点。
二、细菌性斑点病
症状
此病主要是由cercosp a菌所造成，发生在叶上，叶面上散布着5mm～10mm大小的淡黄色圆形状病斑，叶的背面伴着尘土状的霉，变黑色斑点，此黑色的霉状物为病原菌的分生孢子。此病发生在高温炎热的夏季，在蝴蝶兰中一些较惧光惧热的品种，像是p.lueddemanniana， p.mariae， p. micholitzii ... 等，最容易发生，此病多会伴随着肥伤，药伤，日烧病发生，是由于浇水所造成，初发生时,一般均会以可湿性粉剂治疗，但病情仍会持续恶化，令人感觉无法控制，最后叶肉组织坏死，变成有如烧灼后的黑色。
防治方法
1、进入夏季时，注意种植场所通风，利用晚间浇水。
2、施肥时直接浇灌盆内，尽量避免喷洒叶面。
3、有发病的植株，移至通风阴凉处。
三、白绢病
症状
最初老叶软化变黄，逐渐枯干，蔓延到心部而死亡。
防治方法
1、发现症状时，用刀切除有病斑的假球茎，连同栽植的盆器、植料、用火烧毁。
2、 留下健康的假球茎，用清水洗净，再侵入75%百菌清可湿性粉剂600倍液或1%硫酸铜10分钟消毒，再栽入新植料中，或用70%甲基托布津可湿性粉剂或50%多菌灵可湿性粉剂500倍液浇灌茎基，隔7天浇1次。
四、花瓣灰斑病
危害症状
花及萼片，病征为小圆色斑点。
防治方法
预防重要，开花初期每隔1～2个月喷施一次下列药剂：
50%扑灭宁可湿粉剂、50%依普同可湿性粉剂，23.7%福元精水悬粉、50%益发剂。(欲使用之药剂先试喷少许植株，确定对蝴蝶兰花朵无药害后再喷施)。
五、斑点病
(uredo japanica b. et.c. spot)
症状
此病多发于兰花的叶上，发病初期是叶上有直径约2～3mm的圆形黑褐色斑点，会腐烂局部或是整个组织，是一种真菌病，其传染则是由叶下的孢子。此病多发生于低温，多湿的天气且通风不良。
防治方法
1、使叶面常保持干燥。
2、阴湿或寒冷天气的晚上勿浇水。
3、使养兰的处所保持通风，勿使多湿的空气淤滞。
六、炭疽病
症状
种植太密，通风不良、水分失调或伤口病原容易侵入发生。患病初期叶片产生褐色凹陷小点，以后扩大成圆形或不规则病斑，严重时病斑中央有坏疽现象。
防治方法
1、种植勿太密，光照、排水、通风需良好。
2、养成健壮植株，勿日灼、寒害、药害、肥害。
3、切除患部，每隔2周喷洒代森锰锌500倍液或克菌丹500～600倍液，作为平时预防。
4、治疗时可用50%多菌灵可湿性粉剂500倍液或咪鲜胺3000倍液，每周喷洒1次。
七、褐腐病
(bacillus cypriped)
症状
是兰花病害中最厉害的一种，初期发病在叶或茎内显有肉桂色，或淡焦褐色，渐次变为浓褐色表面呈皱折状，周边如淡色水湿状。此病发展极快，早晨尚为一淡焦褐色斑点，中午已使受害部变为黄白色，至下午或翌晨则已全株变为褐色而腐烂。它是一种细菌性病，大多发生于春夏秋各季，尤以春夏之季梅雨期最甚，因雨期空气中湿气甚多，兰株生长快速，叶肉组织柔弱，一但得病，极易蔓延。
防治方法
1、如发现病害尚未扩大时，即将发病部份剪除，切除部份可以用杀菌粉直接涂抹，并应停止浇水一周。
2、如发现全株受害，将全株一同丢弃或烧毁。
3、在梅雨季或是雨季时，经常喷洒杀菌粉约1000倍稀释液预防。
4、常使养殖场所阳光充分，通风良好，并保持清洁。
八、生理性病害
【低温黄斑】
症状
白花品系发生率高。小苗叶表上为黄色斑点，成株则为圆形黄斑呈单一圆或同心圆状。
防治
冬季温室内温度保持在20度以上。择黄圆斑发生率较低的品系作为育种及繁殖的亲本。
【日烧烫伤】
症状
叶黄，严重者变成黑色之焦状或白色之褪色斑。烫伤部位长出新叶后有变形之现象。
防治
尽量减少温室内之光线强度，浇水时尽量沾到叶上。
【低温寒害】
症状
叶基部出现水浸状黄绿色之症状，数日后呈白色之凹陷干枯状，严重者叶随后即脱落。
防治
低温出现时，做好保温预防工作。
【药害】
防治
蝴蝶兰对药剂抵抗力较弱，使用前应小规模试用1～2次。尽量避免药剂混用。
九、软腐病
症状特点
病斑可发生于叶片任何部位，一般情况下叶柄基部较多，发生于叶片上的病斑，初为水渍状小点，后迅速扩大，呈椭圆形或圆形病斑，并迅速扩大为淡褐腐烂斑，从叶背侵入的病原菌，叶面呈黄色病斑。从根茎处侵入病原菌，则整株迅速变黄。软腐病腐烂处发出臭气，接着被害部崩溃，内含物流出，病部呈纸状干涸。病斑向外扩展速度，平均每24小时5～10厘米，2～3天后，全叶软腐溃烂。如不及时采取防治措施，病部可向其他叶片和根区蔓延，引起全株腐烂死亡。
病原
为一种欧式杆菌属细菌;短杆状，两端较圆，大小为(1.2～1.9)微米×(0.5～0.9)微米，革兰氏染色阴性，鞭毛周生，2～4条，不产生荚膜和芽孢。将患有此病的病叶组织一小块，最好是取自病部与健康组织交界处切下，放在玻片上的水滴中，加盖玻片轻压后，立即放在显微镜低倍视野下检查，切口处常有大量混浊的细菌溢流出。
发病特点
品种特性、栽培条件、气候条件对于病害的发生与发展都直接或间接影响，掌握、运用这些规律，加强栽培管理，对于软腐病防治有十分重要的意义。
1、不同季节对软腐病的影响：蝴蝶兰软腐病一年四季均可发生，但在冬季，即所谓蝴蝶兰休眠季节，软腐病发生较轻，荫棚栽培蝴碟兰软腐病每日株发病率为0.01%～0.02%，且在器官内扩展蔓延速度慢;3～4月份后，