柑桔裙腐病又称柑桔脚腐病、柑桔疫霉病，是由好气性疫霉菌引发的真菌性传染病。可入侵植株枝、叶、茎、根等组织，形成水渍状斑点，导致组织腐烂并且不断扩大。发病病斑变褐色，流出松香状胶粒或引发斑状霉烂，引致植株叶片退绿、枯黄，影响品质和产量，甚至导致植株死亡。柠檬为高感品种。本病的感染方式是通过伤口入侵或皮孔、气孔入侵，病菌的游动孢子会随雨水弹射和受污的水流扩散。它是典型的弱感染、强致病病种。带病株及受污的水源、土壤、垃圾等的带菌机会大，是生产上的传染源。
一、防治原则
由于此病的感病比较隐蔽，发展较快，具有较高的传染性、危害性大，所以，在防治上应坚持以防为主的方针，实行以基础防治为本，制度防治为主，治疗防治为辅的原则。
二、防治方法
１、基础性防治。选择地势较高、排灌方便、水源干净、已经水田作物轮作的田地或旱地建园。水田园地坚持大沟高基，高墩设计，高位定植，使经常性有效水位控制在８０厘米左右，且能灌能排。定植前果墩、果穴须经石灰、风干、暴晒等处理，苗木用瑞毒霉锰锌或乙磷铝锰锌等５０倍液蘸根或２５０倍液浸根３０分钟后再行定植。可改用枳等抗裙腐病品种做砧木。
２、制度性防治。种植不带病苗木。定期检查，及早发现，及时处理。该病每年的发病高峰期在４－６月和９－１１月以及在苗木嫁接后４－６个月，因此，必须在每年的４－６月和９－１１月进行两期处理，每期处理３次，每隔１５天顺树干淋乙磷铝锰锌或瑞毒霉锰锌５０倍液一次，或用胶体硫５倍液加熟石灰浆每隔１个月涂白树干一次等；若是小苗则用瑞毒霉锰锌５００倍液喷洒。防止土壤干湿变化过大、肥料过浓且施用过近、耕作碰伤砧木等。
３、治疗性防治。发现树干流胶，先用刀将病部刮干净和刻伤，再涂上瑞霉毒锰锌５０倍液或１：１：１０波尔多浆，或瑞毒霉锰锌５０倍液＋胶体硫５倍液，也可用杀毒矾或乙磷铝锰锌３０倍液等隔７天处理一次，共３次。若病灶发生在主干和主枝，可包扎药物。因裙腐引致树冠枯黄的，应及时将新梢剪除，回缩和疏剪树冠，只保留适量健康枝叶；挖开树蔸的覆土，露出根颈，剪掉烂根，用刀将病斑刮干净和在比病斑略大的范围每隔约２厘米纵刻一刀；涂上上述药物，隔５－７天后，回填干净河沙或火烧土，将伤口覆盖，并用瑞霉素５０倍液＋生根剂淋湿覆盖的河沙或火烧土等，然后用薄膜覆盖保湿处理，１０天左右再淋一次上述药物；若温度合适，经１５天左右，就会在伤口长出新根，这时可结合根外追肥，用０．３％复合肥液＋瑞毒霉５００倍液每隔１０天左右喷树冠和淋树盘，可促进根系发育和树势恢复。